O najwyższej jakości pracy laboratorium mikrobiologicznego Prolab świadczy wdrożony i certyfikowany System Zarządzania Jakością w oparciu o normę PN-EN ISO 9001:2015. Prolab działa także zgodnie z wymaganiami Systemu Zarządzania w Laboratoriach Badawczych według normy PN-EN ISO/IEC 17025:2018. W latach 2013-2017 laboratorium mikrobiologiczne Prolab posiadało wdrożony i certyfikowany przez Polskie Centrum Akredytacji System Zarządzania w Laboratoriach Badawczych według normy PN-EN ISO/IEC 17025:2005.
Z uwagi na świadczone przez Prolab usługi w zakresie badań diagnostycznych oraz klinicznych, laboratorium mikrobiologiczne zostało wpisane do Ewidencji Laboratoriów prowadzonej przez Krajową Radę Diagnostów Laboratoryjnych i otrzymało numer identyfikacyjny: 3425.
Nadrzędnym celem Prolab jest spełnianie oczekiwań Klientów poprzez oferowanie usług najwyższej jakości. Cel ten osiągany jest dzięki wykwalifikowanemu personelowi, najnowszym metodom badawczym oraz nowoczesnemu wyposażeniu największych światowych koncernów. Jakość pracy laboratorium mikrobiologicznego Prolab oceniana jest na podstawie udziału w badaniach biegłości/porównaniach międzylaboratoryjnych organizowanych przez: